2. 按“R”键，进入“Microsoft Windows XP (TM) 故障恢复控制台”界面；故障恢复控制台提供系统修复和故障恢复功能。系统这时会搜寻已安装的Windows XP系统文件，然后显示搜寻结果，并询问“要登录到哪个Windows XP安装（要取消，请按Enter）”，选择1. D:Windows，回车，系统会再询问“管理员密码”，再键入安装Windows XP时设置的管理员密码，回车，出现D:Windows〉，这时需要输入修复命令Fixboot，后面的参数为启动扇区要写入的磁盘盘符，这里填入C:，回车。修复完成，键入Exit退出。重启后就会看到久违的双重启动菜单了。并且，这样修复后基本不产生垃圾文件。
恢复Windows Me和Windows XP双重引导的方法是：
1、启动Windows Me后，执行Windows XP的安装程序。
2、按照正常的安装过程，在安装第一步“安装选项”中选择“全新安装(高级)”。
3、输入安装密码，跳过“升级驱动器”(不选“升级为NTFS文件系统”)和“下载更新的安装程序文件”两步。
4、系统开始复制安装文件，等绿色的复制进度条到头后，出现“重新启动计算机”的红色进度条，此时，迅速按下“Esc”键，禁止重新启动(成功禁止重新启动则直接进入第7步)。
5、如果没有及时按下“Esc”键而导致系统重新启动，将会出现启动选择菜单，其中包括三个启动选项(格式化C盘后重装，则只出现后两项)：
Microsoft Windows XP Professional
Microsoft Windows Millennium Edition
Microsoft Windows XP Professional安装程序
6、按小键盘区的方向键，在5秒钟内选择“Microsoft Windows Millennium Edition”启动Windows Me。
7、进入C盘即可看到，根目录上已经出现了实现双引导启动需要的五个文件：“Ntldr”、“Ntdetect.com”、“Boot.ini”、“Bootfont.bin”、“Bootsect.dos”。
此外还有Windows XP的三个安装文件“ldr”、“drvltr.~_~”、“txtse-tup.sif”和一个文件夹“win_nt.~bt”，其他分区也各有一个磁盘加速文件“DRVLTR.~_~”，直接删除即可。
8、修改Boot.ini文件。在[Boot Loader]段中：将“Default=C:＼WIN_NT.~BT＼BOOTSECT.DAT”一行改为“Default=C:＼”，如果不从启动选择菜单中进行选择，默认从C盘引导启动Windows Me；或改为“Default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)＼WINDOWS”，使系统默认从D盘引导启动Windows XP(如果Windows XP安装在E盘，将“partition(2)”中的“2”改为“3”、以此类推)。
同时，还可在[Boot Loader]段中设定启动选择菜单维持的时间(以秒为单位)，将“Timeout=5”中的“5”改为你希望的时间即可。
在[Operating Systems]段中，删除“C:＼WIN_NT.~BT＼BOOTSECT.DAT="Microsoft Windows XP Professional安装程序"”一行，即可将Windows XP的安装选项从启动选择菜单中屏蔽掉。若是格式化C盘后重装Windows Me，还需加入“multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)＼WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional"/fastdetect”一行，使系统以快速启动的方式从D盘引导Windows XP。同时，还可以在[Operating Systems]段中修改启动选择菜单显示的文字，比如：将“Microsoft Windows XP Professional”改为“Windows XP中文版”、“Microsoft Windows Millennium Edition”改为“Windows Me千禧版”，之后，选择引导菜单上显示的就是“Windows XP中文版”和“Windows Me千禧版”了。
9、重新启动就恢复双重引导了，并且，Windows XP的全部设置百分之百保持原来的状态，与重装Windows Me前没有丝毫改变。